率领左右羽林五营军士屯于都亭，整点武器，镇守皇都
又以自函谷关、大谷、广城、伊阙、轘辕、旋门、孟津、小平津等各皇都关口，设置都尉驻防;又下诏各地严防，命各州郡府作战黄巾、日夜训练士兵、整点武器、召集义军。
而另一方面最早期发精兵镇压各地主力黄巾乱事的朝廷军队:
在卢植领着副将宗员率领北军五校士一直负责以北战线，与张角主力周旋;大大小小数十战，死伤无数，双方都有败有胜，一时之间谁也奈何不了谁、
而皇甫嵩及朱儁各领一军、
控制五校、三河骑士及刚刚招募来的精兵勇士共四万多人
在颍川一带平反黄巾军，开始汉庭还可打的黄巾军节节败退，久而久之，黄巾越战越勇，与汉军交战不分平色，甚至有时还小胜。
朱儁上表下的孙坚为佐军司马更是表现出色，带领着同乡里青状年千余人、期间招募近万人，在孙坚有勇有谋带领下，连破几城，杀得黄巾落方而逃，收降过万黄巾，几次战下孙坚部队越发越大。
孙坚十分英勇，数次遇上黄巾军大部队都让孙坚以少胜多杀得黄巾片甲不留，一路杀去与朱儁军连军，对抗在颍川的黄巾主力。
而这个时候却传出黄巾军张曼成攻杀入南阳太守秦颉郡守褚贡阵亡，守兵阵亡近万，南阳大部地域被黄巾占领。
消息传出后、、、汉庭将领十分忧心。
一时间，各大黄巾士气大涨这是黄巾军起义后首次拿下主要城池，南阳的失守，给了朱儁镇守的颍川和洛阳镇守的朝廷军队非常大压，不敢随意调动军队，深怕南阳黄巾突袭洛阳。
如果南阳黄巾张曼成连接颍川黄巾的话，朱儁与孙坚镇守的颍川一带就比较危险了、如果朱儁与孙坚失败，朝廷军队就只有皇甫嵩在颍川另一边，就难以独守，颍川在落在黄巾手里，帝都就更危险了。
到时候张曼成、波才等黄巾主要将领就会带领黄巾迎合张角，一举包围洛阳，到时候大汉朝廷就万分危险了。
直至4月，朱儁军终于被黄巾波才所败而撤退，撤到长社。
朱儁找到皇甫嵩相量，为了不被各个唯有与他一起进驻长社防守。
而波才率众黄巾军大军围城，皇甫嵩和朱儁加起来的汉军都没有黄巾多，汉军士气低落。
这时候又传来汝南黄巾军在邵陵打败太守赵谦，广阳黄巾军杀死幽州刺史郭勋及太守刘卫，黄巾军一时气势高涨，并未因汉室的各洲郡参战动作而有败退的迹象。
5月初，皇都见皇甫嵩被围。
而这时候招兵买马的曹操已经招募差不多了，事情又比较紧急，皇帝派曹操率军救援。不过援军还未来到时。
皇甫嵩和朱儁想到一计，在傍晚时分吹起大风，皇甫嵩命士兵偷偷出城，到了敌军营，点亮火把，利用黄巾军营寨周围的杂草，用火烧敌人军营，大呼进攻，城上亦举出火把来应响，皇甫嵩以鼓助战，冲入敌阵，黄巾军大乱，四处奔走，而波才一路被皇甫嵩派兵追杀着。
又遇上正好来支援的曹操，这时候黄巾军，被皇甫嵩、朱儁和曹操三面夹击，斩杀数万人，汉军大获全胜。
6月，皇甫嵩命曹操与孙坚为左右先锋，带领军士前去与张曼成战斗，而皇甫嵩和朱儁留守阵地，经过几天的较量，最终斩杀了张曼成，黄巾见主帅已死，毫无战意纷纷逃跑。
张曼成死后，这一带黄巾军便改以韩忠为帅，（书上记载，张曼成死后是赵弘统帅的，但是我个人比较喜欢赵弘，所以不忍他身亡，改了下，原谅我的自私）带领以十多万黄巾转去占据宛城，修生养息，等待张角指示。
留下除了守城将领，
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